I don't mean in like a protect-the-environment way.
環境保護的な意味ではありません。
→I don't mean in like a ... way. 〜的な意味ではない。（相手に誤解を与えるような表現を訂正する）

It is an honor to meet you.
お会いできて光栄です。

It is an honor to work with all of you.
皆さんと一緒に働くことができて光栄でした。（退職するときのあいさつでの決まり文句）

It is an honor to be here today.
本日はお招きいただき光栄です。（スピーチの冒頭での決まり文句）